Ученые Центра геномной биоинформатики им.
Ф.Г. Добржанского СПбГУ выпустили интернет-платформу GWATCH, которая
обещает повысить эффективность обнаружения и подтверждения геномных
вариантов, отвечающих за устойчивость к хроническим заболеваниям
человека. Доступ к геномному браузеру будет открытым — любой ученый
сможет пользоваться его ресурсами.
Как сообщили "Росбалту" в пресс-службе СПбГУ, геномный
браузер GWATCH — это размещенная на сервере СПбГУ интернет-платформа для
автоматического анализа данных с целью обнаружения генов, отвечающих за
комплексные заболевания человека.
Аббревиатура GWATCH расшифровывается как Genome-Wide Association
Tracks Chromosome Highway, что означает "хромосомная магистраль
для полногеномного поиска ассоциаций".
По словам разработчиков, GWATCH является передовой вычислительной
средой с удобным пользовательским интерфейсом, позволяющим
исследователям просматривать данные геномных ассоциаций, подтверждать
новые ассоциации и обнаруживать важные аспекты генетического
воздействия, идентификация которых была ранее крайне трудна.
Браузер GWATCH также позволяет найти решение сложной этической
проблемы, которая давно затрудняет проведение исследований генома
человека. Ученые убеждены, что информация должна свободно
распространяться в научной среде — это позволит оперативно знакомиться с
новыми данными и уточнять их. Однако требование конфиденциальности
личной информации (в большинстве случаев являющееся условием проведения
исследования) препятствует загрузке генетических и клинических данных
больных на открытые интернет-ресурсы. Геномный браузер GWATCH позволяет
хранить информацию в открытом доступе, отображая только производные
данные анализов на уровне популяции. Персональные сведения больных при
этом не раскрываются. Таким образом, браузер позволит открыто
публиковать больше информации без нарушения соглашений о
конфиденциальности, которые заключаются с большинством участников
исследований.
